MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 58485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008044	GCA	2	6	40	45	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079842
2	NC_008044	GAC	2	6	51	56	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079842
3	NC_008044	CTA	2	6	66	71	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079842
4	NC_008044	AAC	2	6	102	107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079842
5	NC_008044	CAC	2	6	110	115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079842
6	NC_008044	GGC	2	6	150	155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079842
7	NC_008044	CAA	2	6	236	241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079842
8	NC_008044	CCCG	2	8	295	302	0 %	0 %	25 %	75 %	99079842
9	NC_008044	CAAC	2	8	306	313	50 %	0 %	0 %	50 %	99079842
10	NC_008044	AAG	2	6	379	384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079842
11	NC_008044	CGC	2	6	403	408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079842
12	NC_008044	AGA	2	6	410	415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079842
13	NC_008044	CG	3	6	497	502	0 %	0 %	50 %	50 %	99079842
14	NC_008044	GGC	2	6	552	557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079842
15	NC_008044	AC	3	6	573	578	50 %	0 %	0 %	50 %	99079842
16	NC_008044	ATGC	2	8	582	589	25 %	25 %	25 %	25 %	99079842
17	NC_008044	CCG	2	6	643	648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079842
18	NC_008044	GAT	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079842
19	NC_008044	TGG	2	6	736	741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079842
20	NC_008044	TTC	2	6	786	791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079842
21	NC_008044	TGG	2	6	808	813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079842
22	NC_008044	ATC	3	9	828	836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079842
23	NC_008044	TGG	3	9	907	915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079842
24	NC_008044	GCA	2	6	968	973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079842
25	NC_008044	GCT	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079842
26	NC_008044	TGC	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079842
27	NC_008044	GC	3	6	1154	1159	0 %	0 %	50 %	50 %	99079842
28	NC_008044	ACA	2	6	1213	1218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079842
29	NC_008044	ATC	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079842
30	NC_008044	GC	3	6	1263	1268	0 %	0 %	50 %	50 %	99079842
31	NC_008044	CGCT	2	8	1311	1318	0 %	25 %	25 %	50 %	99079842
32	NC_008044	TGG	2	6	1340	1345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079842
33	NC_008044	ACC	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079842
34	NC_008044	TGC	2	6	1432	1437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079842
35	NC_008044	CGCT	2	8	1440	1447	0 %	25 %	25 %	50 %	99079842
36	NC_008044	GGT	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079843
37	NC_008044	GTGAT	2	10	1857	1866	20 %	40 %	40 %	0 %	99079843
38	NC_008044	GTC	2	6	1895	1900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079843
39	NC_008044	CCA	2	6	1935	1940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079843
40	NC_008044	CCA	2	6	1950	1955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079843
41	NC_008044	AGA	2	6	2080	2085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079843
42	NC_008044	GCC	2	6	2135	2140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079843
43	NC_008044	GCG	2	6	2146	2151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079843
44	NC_008044	GCGCT	2	10	2252	2261	0 %	20 %	40 %	40 %	99079843
45	NC_008044	CTC	2	6	2375	2380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079843
46	NC_008044	GAC	2	6	2387	2392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079843
47	NC_008044	CTGTCT	2	12	2403	2414	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	99079843
48	NC_008044	CCG	2	6	2518	2523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079843
49	NC_008044	CG	3	6	2594	2599	0 %	0 %	50 %	50 %	99079843
50	NC_008044	TGA	2	6	2614	2619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079843
51	NC_008044	TGT	2	6	2631	2636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079843
52	NC_008044	GAA	2	6	2666	2671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079843
53	NC_008044	GCTG	2	8	2674	2681	0 %	25 %	50 %	25 %	99079843
54	NC_008044	CGA	2	6	2692	2697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079843
55	NC_008044	TCT	2	6	2728	2733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079843
56	NC_008044	GA	3	6	2757	2762	50 %	0 %	50 %	0 %	99079843
57	NC_008044	CGA	2	6	2818	2823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079843
58	NC_008044	GCGG	2	8	2973	2980	0 %	0 %	75 %	25 %	99079844
59	NC_008044	CAA	2	6	3018	3023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079844
60	NC_008044	GTT	2	6	3060	3065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	99079844
61	NC_008044	CGGGG	2	10	3071	3080	0 %	0 %	80 %	20 %	99079844
62	NC_008044	GC	3	6	3087	3092	0 %	0 %	50 %	50 %	99079844
63	NC_008044	GC	3	6	3109	3114	0 %	0 %	50 %	50 %	99079844
64	NC_008044	TCC	2	6	3157	3162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079844
65	NC_008044	CCT	2	6	3185	3190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079844
66	NC_008044	ACA	2	6	3224	3229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079844
67	NC_008044	TCGC	2	8	3260	3267	0 %	25 %	25 %	50 %	99079844
68	NC_008044	TGGT	2	8	3274	3281	0 %	50 %	50 %	0 %	99079844
69	NC_008044	GCG	2	6	3321	3326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079844
70	NC_008044	ATCGC	2	10	3338	3347	20 %	20 %	20 %	40 %	99079844
71	NC_008044	CATC	2	8	3492	3499	25 %	25 %	0 %	50 %	99079844
72	NC_008044	GCT	2	6	3532	3537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079844
73	NC_008044	GC	5	10	3793	3802	0 %	0 %	50 %	50 %	99079844
74	NC_008044	CTG	3	9	3832	3840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079844
75	NC_008044	GGC	2	6	3849	3854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079844
76	NC_008044	GCG	2	6	3870	3875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079844
77	NC_008044	CG	3	6	3964	3969	0 %	0 %	50 %	50 %	99079844
78	NC_008044	CTGG	2	8	4094	4101	0 %	25 %	50 %	25 %	99079845
79	NC_008044	TGG	2	6	4105	4110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079845
80	NC_008044	TGG	2	6	4124	4129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079845
81	NC_008044	CAA	2	6	4321	4326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079845
82	NC_008044	GGCG	2	8	4367	4374	0 %	0 %	75 %	25 %	99079845
83	NC_008044	ACG	2	6	4574	4579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079845
84	NC_008044	GAG	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079845
85	NC_008044	GGT	2	6	4679	4684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079846
86	NC_008044	GAC	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079846
87	NC_008044	TTC	2	6	4861	4866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079846
88	NC_008044	GTG	2	6	4880	4885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079846
89	NC_008044	GTAGC	2	10	4891	4900	20 %	20 %	40 %	20 %	99079846
90	NC_008044	GAT	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079846
91	NC_008044	CG	4	8	5022	5029	0 %	0 %	50 %	50 %	99079846
92	NC_008044	ATT	2	6	5150	5155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99079846
93	NC_008044	CAG	2	6	5170	5175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079846
94	NC_008044	TCT	2	6	5197	5202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079846
95	NC_008044	GCG	2	6	5205	5210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079846
96	NC_008044	CG	3	6	5209	5214	0 %	0 %	50 %	50 %	99079846
97	NC_008044	TGC	2	6	5419	5424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079847
98	NC_008044	GCC	2	6	5429	5434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079847
99	NC_008044	G	6	6	5494	5499	0 %	0 %	100 %	0 %	99079847
100	NC_008044	TGG	2	6	5571	5576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079847
101	NC_008044	TGG	2	6	5591	5596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079847
102	NC_008044	G	6	6	5595	5600	0 %	0 %	100 %	0 %	99079847
103	NC_008044	GAT	2	6	5698	5703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079847
104	NC_008044	AAG	2	6	5783	5788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99079847
105	NC_008044	GCG	2	6	5849	5854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079847
106	NC_008044	CAG	2	6	6037	6042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079848
107	NC_008044	CAC	2	6	6141	6146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079848
108	NC_008044	GTC	2	6	6159	6164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079848
109	NC_008044	CGA	2	6	6176	6181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079848
110	NC_008044	GGCC	2	8	6188	6195	0 %	0 %	50 %	50 %	99079848
111	NC_008044	GTGA	2	8	6243	6250	25 %	25 %	50 %	0 %	99079848
112	NC_008044	GCA	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079848
113	NC_008044	TCA	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079848
114	NC_008044	CGG	2	6	6368	6373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079848
115	NC_008044	TCGC	2	8	6457	6464	0 %	25 %	25 %	50 %	99079848
116	NC_008044	GTG	2	6	6498	6503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079848
117	NC_008044	GTG	2	6	6642	6647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079848
118	NC_008044	GAGC	2	8	6677	6684	25 %	0 %	50 %	25 %	99079848
119	NC_008044	GCG	2	6	6697	6702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079848
120	NC_008044	GATG	2	8	6746	6753	25 %	25 %	50 %	0 %	99079848
121	NC_008044	GAC	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079848
122	NC_008044	TGG	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079848
123	NC_008044	TGC	2	6	6835	6840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079848
124	NC_008044	CAA	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079848
125	NC_008044	GC	3	6	6898	6903	0 %	0 %	50 %	50 %	99079848
126	NC_008044	TCC	2	6	6933	6938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079848
127	NC_008044	CGA	2	6	6974	6979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079848
128	NC_008044	CG	4	8	6980	6987	0 %	0 %	50 %	50 %	99079848
129	NC_008044	TG	3	6	6999	7004	0 %	50 %	50 %	0 %	99079848
130	NC_008044	CT	3	6	7005	7010	0 %	50 %	0 %	50 %	99079848
131	NC_008044	AG	3	6	7085	7090	50 %	0 %	50 %	0 %	99079848
132	NC_008044	GGT	2	6	7148	7153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079848
133	NC_008044	ATC	2	6	7161	7166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079848
134	NC_008044	GC	3	6	7179	7184	0 %	0 %	50 %	50 %	99079848
135	NC_008044	GCC	2	6	7188	7193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079848
136	NC_008044	GC	3	6	7200	7205	0 %	0 %	50 %	50 %	99079848
137	NC_008044	G	6	6	7322	7327	0 %	0 %	100 %	0 %	99079848
138	NC_008044	GC	5	10	7400	7409	0 %	0 %	50 %	50 %	99079848
139	NC_008044	TCA	2	6	7519	7524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079848
140	NC_008044	GCT	3	9	7562	7570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079848
141	NC_008044	TTC	2	6	7575	7580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99079848
142	NC_008044	GCC	2	6	7631	7636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99079848
143	NC_008044	GAC	2	6	7695	7700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079848
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145	NC_008044	TGC	2	6	7732	7737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079848
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148	NC_008044	TGC	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079848
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150	NC_008044	GGA	2	6	8198	8203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99079848
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152	NC_008044	CTG	2	6	8301	8306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079848
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156	NC_008044	GAT	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079849
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159	NC_008044	GAT	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079849
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164	NC_008044	GAT	2	6	9079	9084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99079849
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173	NC_008044	TGG	2	6	9612	9617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99079850
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246	NC_008044	ACT	2	6	13029	13034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079852
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250	NC_008044	AAAGA	2	10	13154	13163	80 %	0 %	20 %	0 %	99079852
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253	NC_008044	CTC	2	6	13255	13260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	99079852
254	NC_008044	TGC	2	6	13266	13271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079852
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257	NC_008044	CCA	2	6	13434	13439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99079853
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260	NC_008044	GCA	2	6	13523	13528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99079853
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264	NC_008044	ACA	2	6	13769	13774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99079853
265	NC_008044	TGC	2	6	13837	13842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99079853
266	NC_008044	CAT	2	6	13923	13928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99079853
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268	NC_008044	GGC	2	6	13953	13958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079853
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290	NC_008044	CGG	2	6	14926	14931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079854
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401	NC_008044	GGC	2	6	21576	21581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99079860
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403	NC_008044	CG	3	6	21840	21845	0 %	0 %	50 %	50 %	99079860
404	NC_008044	GC	3	6	21874	21879	0 %	0 %	50 %	50 %	99079860
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